BIOLOGIA MOLEKULARNA 2

 0    171 kartičky    chomikmimi
stáhnout mp3 Vytisknout hrát zkontrolovat se
 
otázka język polski odpověď język polski
Białka, światło?
začněte se učit
Światło o długośi 280 nm
Absorpcja gdzie najwieksza
začněte se učit
dla nukleotydów
Absorpcja gdzie najmniejsza
začněte se učit
dla dsDNA
Od czego zależy współczynnik ekstyncji'?
začněte se učit
Od długości badanej cząsteczki
co znaczy hipochromizm
začněte se učit
mniej barwny
dsDNA o stęż 1mg/ml ile a?
začněte se učit
a260 = 20
RNA i ssDNA ile a?
začněte se učit
a260- 25
co ma wyższy współczynnik ekstynkcji, puryny czy pirymidyny?
začněte se učit
puryny
Topnienie (ogrzewanie) - absorbancja?
začněte se učit
40% wzrost absorbancji
Szybkie ochładzanie - absorbancja?
začněte se učit
Minimalny spadek absorbancji
Wolne ochładzanie - absorbancja?
začněte se učit
Absorbancja bez zmian
Wektor, jaka zdolność
začněte se učit
Zdolność do izolacji od gospodara i replikacji
Fag alfa, zdolność?
začněte se učit
Zdolność do klonowania większych fragmentów
h13 zdolność?
začněte se učit
zdolność do klonowanie fragmentów jednoniciowych
co to kosmid?
začněte se učit
plazmid + fag alfa
Episomalne plazmidy są wektorami dla?
začněte se učit
Są wektorami dla drożdzy
Plazmid Ti wektor dla?
začněte se učit
Roślin
Biblioteki DNA
začněte se učit
zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne
začněte se učit
analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne
začněte se učit
są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+, Rb2+
Transformanty, gdzie najpierw są przechowywane?
začněte se učit
w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja)
Gdzie po selekcji są przechowywane transformanty?
začněte se učit
Są zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy), tzw. zapas glicerolowy
Co robi fosfotaza alkaliczna?
začněte se učit
ten enzym usuwa reszty fosforanowe z 5'
co robi polimeraza DNA I?
začněte se učit
ten enzym odpowiada za syntezez nici z 5->3
co to Fragment klenowa?
začněte se učit
ten enzym to pochodna polimerazy DNA I, brak własciowsci egzonukleazy
Nukleaza fasoli mung co to
začněte se učit
ten enzym trawi jednoniciowe fragmenty naprzeciw pęknięcia nici
ODWROTNA TRANSKRYPTAZA
začněte se učit
Zależna od RNA, synteza DNA komplementarnego do RNA w kierunku 3->5 od startera z 3'OH
czego wymaga odwrotna transkryptaza?
začněte se učit
trifosforanów deoksyrybonukelozydów
co robi RNAza A?
začněte se učit
ten enzym trawi RNA
co robi RNAza H?
začněte se učit
ten enzym trawi RNA hybrydy DNA-RNA
Terminalna transferaza co robi
začněte se učit
ten eznym dodaje nukleotydy do końca 3' a jak GTP to powtaje ogon oligoG
A260/a280 = 1,8 a czystość dna
začněte se učit
Czyste DNA
a260/280 < 1,8 a czystosc DNA
začněte se učit
zanieszczone białkiem
a260/280 > 1,8 a czystosc DNA
začněte se učit
zanieszczyczone RNA
co to Wirowanie izopikniczne
začněte se učit
równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia wirowanie izopikniczne?
začněte se učit
Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Gęstość DNA w wirowaniu izopiknicznym?
začněte se učit
1,7g/cm3
Co robi RNA i białka w wirowaniu izopiknicznym?
začněte se učit
RNA w dół, białka flotują(unoszą się)
Jaki barwnik w elektroforezie?
začněte se učit
różowo/pomarańczowy bromek etydyyny
jak zachodzi elektroforeza
začněte se učit
od KATODY (-) do ANODY (+)
Od czego zależy szybkość migracji kolistego DNA w elektroforezie?
začněte se učit
od warunków
Napięcie w elektroforezie
začněte se učit
5-8 V/cm3
Gdzie najlepiej widoczna elektroforeza?
začněte se učit
w RNA
Jakie środowisko zachodzenia elektroforezy?
začněte se učit
W żelu agarozowym (bromek etydyny) lub poliakrydynowym (AgNO3/SYBR)
co to metoda gRTPCR?
začněte se učit
real time, analiza ilości produktów w czasie rzeczywistym
czego używa się w gRTPCR?
začněte se učit
SYBR
cechy SYBR
začněte se učit
nietoksyczny i silnie wiążacy DNA
Kiedy zachodzi analiza w gRTPCR?
začněte se učit
analiza w czasie trawienia
czego analiza w gRTPCR?
začněte se učit
Analiza polimorfizmu pojedynczych nukleotydów
Co jest znakowane w gRTPCR?
začněte se učit
nukleotydy i sondy
Elektroforeza mikrokapilarna
začněte se učit
z wykorzystaniem macierzy
Elektroforeza kapilarna
začněte se učit
w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, z cienkiej kapilarze kwarcowej
W żelu poliakrydynowym elektoforeza (PZ)
začněte se učit
5-1000 pz (gRTPCR)
w żelu agarozowym elektroforeza
začněte se učit
0,1 - 20 kpz
w polu pulsacyjnym elektroforeza
začněte se učit
20kpz - 10 Mpz, oddziela cząsteczki wielkości 100kpz
Choroba takahary, inna nazwa
začněte se učit
alaktazemia
jaki gen, choroba Takahary?
začněte se učit
Gen kontrolujący syntezę katalazy, krótkie ramie chromosomu 11 (11p13)
jak dziedziczona alaktazemia?
začněte se učit
autosomalnie recesywnie
Na czym polega alaktazemia?
začněte se učit
Redukcja aktywnośći katalazy
gdzie najczęściej alaktazemia?
začněte se učit
Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Objawy alaktazemii
začněte se učit
Owrzodzenie śluzówek jamy ustnej, podudzi, oraz wczesne wypadanie zębów
Cholinoesteraza
začněte se učit
gen na 3 chromosomie i tam mutacja
Wrażliwość na chlorek suksametonium, objawy?
začněte se učit
zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale też szybko zanika. (za objawy odpowiada hydroliza sukcynylocholiny)
za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialna jest?
začněte se učit
cholinoesteraza
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
začněte se učit
autosomalnie dominująco
Przez co wywoływana hipertermia złośliwa
začněte se učit
leki znieczulenia ogólnego: antystetyki wziewne, dożylne, leki zwiotczające, glikozydy naprastnicy
Objawy hipertemia złośliwa
začněte se učit
wzrasta napięcie mięsni prązkowanych, drzenie mięsniowe, pojawa się tachykardia i wzrost temperatury ciała(1 stopien w ciagu 5 min)
Mutacja genu 19q13.1
začněte se učit
Koduje receptor rianodynowy uwalniajacy wapń z retikulum do cytoplazmy ->hipertermia złośliwa
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
začněte se učit
autosomalnie dominująco
Alaktazemia jaki gen
začněte se učit
11p13
jak dziedziczona alaktazemia?
začněte se učit
autosomalna recesywna
Metaboizm alkoholu etylowego, jakie enzymy?
začněte se učit
Dehydrogenaza alkoholowa ADH i dehydrogenaza aldehydowa ALDH
gdzie dehydrogenaza alkoholowa ADH?
začněte se učit
chromosom 4
gdzie dehydrogenaza aldehydowa ALDH?
začněte se učit
1-chromosom 9, 2-chromosom 12
Porifiryny
začněte se učit
prekursory hemu i składniki enzymów
na jakie dzielimy porifiryny
začněte se učit
na wątrobowe i erytropoetyczne
Porfirie, na czym polega
začněte se učit
Deficyt enzymów biorących udział w przemianach porfiryn
Jak dziedziczone porfirie?
začněte se učit
Autosomalnie dominująco
Krzywica odporna na wit D3, jaki gen?
začněte se učit
gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowej, jaki chromosom
začněte se učit
chromosom X
niedobór alfa-1-antytrypsyny, jaki gen i chromosom
začněte se učit
Gen PI, chromosom 14
niedobór paraoksonazy, gen + chromosm
začněte se učit
gen PON1 na chromosomie 7 sprzeżony z genem CFTR
Hemochromatoza, jaki gen
začněte se učit
gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
hipolaktazja, jaki gen
začněte se učit
3 allele na chromosomie 3
fenyloketonuria, jaki gen
začněte se učit
12q24.1
Jak dziedziczona fenyloketonuria?
začněte se učit
autosomalnie recesywnie
Co wywołuje ostrą porfirie?
začněte se učit
Lek, infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizycnzy
Jakie leki wywołują ostrą porfifrie?
začněte se učit
barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanolu,
Kiedy forma enolowa?
začněte se učit
w pH zasadowym
Kiedy forma ketonowa?
začněte se učit
w ph obojętnym
Co to sonikacja?
začněte se učit
Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA
Do czego prowadzi sonikacja?
začněte se učit
Do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkośći
Podział zasad
začněte se učit
Puryny i pirymidyny
Puryny
začněte se učit
adenina i guanina (2 pierścienie)
Pirymidyny
začněte se učit
cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścien)
Co to liza alkaliczna?
začněte se učit
Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosowego DNA i innych
Plazmidy
začněte se učit
Autonomiczne, pozachromosome elementy genetyczne
W jakiej postaci występują Plazmidy?
začněte se učit
w postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
gdzie wystąpują Plazmidy?
začněte se učit
u prokariotów i niektórych eukariotów
Jaka zdolnosc maja plazmidy?
začněte se učit
Zdolność do trwałego utrzymywania się i replikowania w komórce
Plazmidy a chromosomy gospodarza
začněte se učit
Są odrębne od chromosomów gospodrza
Jaką struktuę tworzą plazmidy?
začněte se učit
CCC-DNA
co robi CCC-DNA?
začněte se učit
wykazuje negatywne superskręcenie
Jakie plazmidy nie tworzą struktury CCC-DNA?
začněte se učit
Plazmidy izolowane z hypertermofilnych Archaea, u których jest pozytywne superskręcenie cz. DNA
wielkość plazmidów
začněte se učit
od 1000 pz do 1,7 Mpz
Gdzie najmniejsze plazmidy?
začněte se učit
U Heamophilus somnus, Mycoplasma i Helicobacter pylori
Gdzie największe plazmidy?
začněte se učit
u Rhizobium
Gen kodujący białko (plazmidy)
začněte se učit
30 kDa - 1 kpzC
Co zawierają plazmidy?
začněte se učit
Region początku replikacji
Jakie geny często zawierają plazmidy?
začněte se učit
odporności, np. gen bla / ampr
Co robi gen bla/ampr?
začněte se učit
Koduje beta-laktamaze, która rozkłada antybiotyki penicylowe
NORTHERN BLOT
začněte se učit
dla transferu rozdzielonego elektroforetycznie DNA
SOUTHERNBLOT
začněte se učit
osmoza do wymuszenia węrdrówki soli z pociąganiem DNA ze sobą
WESTERN BLOT
začněte se učit
dla transferu białka
EASTERN BLOT
začněte se učit
dla transferu białek po ich rozdziale w elektroforezie dwukierunkowej
DNA/RNA w środowisku kwasowym
začněte se učit
hydroliza
DNA/RNA w środowisku lżej kwasowym (3-4)
začněte se učit
hydroliza wiązan glikozydowych, kwas apurynowy
DNA/RNA w środowisku zasadowym
začněte se učit
denaturacja (RNA i DNA), hydroliza (RNA, bo ma 2-OH')
Co jest bardziej podatne na hydrolize? DNA czy RNA?
začněte se učit
ZAWSZE RNA
Multipleks PCR
začněte se učit
ampliflikacja równoczesna
Nested-PCR
začněte se učit
wewnętrzna/gniazdowa, gdy mało matryc
RT-PCR
začněte se učit
przepisanie sekwencji z MRNA składającego się z samych eksonów na cDNA - stwierdzanie obecności określonych transkryptów
STS-PCR
začněte se učit
Umożliwia indentyfikację poszczególnych loci dzięki amplifikacji fragmentu DNA pomiędzy parą starterów o znanej sekwencji
STS – ile pz?
začněte se učit
200-300 pz
Zagęszczanie map genetycznych, jaka metoda
začněte se učit
STS-PCR
Poszukiwanie sprzężen z cechami genotypowymi, jaka metoda
začněte se učit
STS-PCR
do uporządkowania bibiloteki genomowej w KONTIGI, jaka metoda?
začněte se učit
STS-PCR
RACE-PCR
začněte se učit
szybka amplifikacja końców Cdna, poznanie dokładnej sekwencji jednego z końców
ASA=PASA=ASP=ARMS
začněte se učit
amplifikacja alleo-specyficzna, wykrywa polimorfizm alleli i mutacji punktowych
ASO
začněte se učit
połączenie hybrydyzacji i PCR
co robi sonda w ASO?
začněte se učit
sonda rozponzacje allel prawidłowy/zmutowany
OLA
začněte se učit
badanie ligacji oligonukleotydów, połączenie PCR i ligacji DNA
REP-PCR
začněte se učit
wykorzystanie sekwencji repetytywnych
AS-PCR
začněte se učit
asymetryczne PCR, amplifikowana tylko 1 nić, na 3' fluorochrom
I-PCR
začněte se učit
odwrócona PCR, DNA oskrzydla znana sekwencje
PCR in situ
začněte se učit
z udziałem znakowanych nukleotydów, czuła i kosztowna
RAPD-PCR
začněte se učit
losowa amplifikacja polimorficznego DNA, umożliwia jednoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
Jaka ilość DNA wyjściowego w RAPD-PCr?
začněte se učit
mała
W jakiej metodzie PCR wykyrywane loci mają dominujący charakter?
začněte se učit
w RAPD-PCR
W jakiej metodzie nie można odróżnić homozygot od heterozygot?
začněte se učit
w RAPD-PCR, bo wizualizacja tylko jednego z dwóch alleli
Badanie jakiego materiału jest zalecane przy RAPD-PCR?
začněte se učit
Haploidalnego materiału
W jakiej metodzie badanie zróżnicowania DNA jądrowego między osobnikami i populacjami?
začněte se učit
RAPD-PCR
Jaka metoda umożliwia szybkie określenie liczby chromatyny X i Y w jądrach interfazowych?
začněte se učit
FISH
FISH umożliwia zlokalizowanie jakich sekwencji DNA?
začněte se učit
nieswoistych sekwencji DNA bezporśrednio w materiale genetycznym
Jakie zmiany bada FISH?
začněte se učit
Zmiany ilościowe w liczbie i strukturze chromosomów
Metoda oparta na fish
začněte se učit
cytogenetyka interfazalna
Do czego hybrydyzacja typu northern?
začněte se učit
do analizy RNA i procesu transkrypcji poszczególnych genów
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji w badanych tkankach - jaka metoda
začněte se učit
Hybrydyzacja typu northern
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji na danym etapie rozwoju - jaka metoda?
začněte se učit
hybrydyzacja typu northern
Poznanie czego jest możliwe dzięki hybrydzacji typu northern?
začněte se učit
Poznanie długości RNA i intensywność jego transkrybcji
Hybrydyzacja RNA-DNA jaka metoda
začněte se učit
northern
Hybrydyzacja DNA-DNA jaka metoda
začněte se učit
southern
HGP
začněte se učit
projekt poznania ludzkiego genomu
knockout
začněte se učit
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego typu
genomika porównawcza
začněte se učit
porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika
začněte se učit
wiedza o zespolach bialek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika
začněte se učit
badanie regulacji ekspresji genów na poziome transkrypcji
gdzie znalezione enzymy restrykcyjne?
začněte se učit
jedynie w komórkach bakterii i sinic
Enzym restrykcyjny jakie sekwencje rozpoznaje?
začněte se učit
Speficzyne sekwencje dwuniciowego DNA o długości 4-8 par zasad
Aktywność STAR
začněte se učit
niespecyficznośćenzymów restrykcyjnych w niektórych warunkach
kiedy aktywność star?
začněte se učit
kiedy trawienie przeprowadza sięwinnych warunkach niż optymalnie
Enzym EcoRI a zmienione warunki
začněte se učit
zmienione warunki mogę uniemożliwić wykrycie struktury GAATTC, którą normalnie rozpoznaje
co to optymalne warunki trawienia
začněte se učit
odpowiednie Ph, stęzenie jonów magnezu
Co pozostawiją enzymy restrykcyjne?
začněte se učit
Końce tępe i lepkie w cząsteczce
Gdy obie nici rozcięte są naprzeciwko siebie równolegle, powstają
začněte se učit
tępe końce
Gdy jednoniciowe sekwencje wystepujace na obu koncach sa przeciete niesymetrycznie, powstaja
začněte se učit
lepkie konce
Restryktazy czworkowe
začněte se učit
rozpoznaja sekwencje DNA co 256pz
Restryktazy szostkowe
začněte se učit
Rozpoznaja sekwencje DNA co 4096 pz
Izoschizomery
začněte se učit
enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Egzonukleazy
začněte se učit
umożliwiaja odpowiednią modyfikacje koncow we fragmentach DNA
polimerazy
začněte se učit
odpowiedzialne za amplifikację odpowiednich odcinkow DNA

Chcete-li přidat komentář, musíte se přihlásit.