Efektywna wielkość populacji

Efektywna wielkość populacji Ne – co to?

jest to taka liczebność wyidealizowanej populacji, w której tempo dryfu genetycznego byłoby takie samo jak w rzeczywistej populacji

wartość Ne a szybkość wzrostu poziomu homozygotyczności populacji

im niższa wartość Ne tym szybciej wzrasta poziom homozygotyczności populacji

jaka będzie efektywna wielkość populacji dla populacji wyidealizowanej?

Ne=2N

Od czego zależy efektywna wielkość populacji w populacjach rzeczywisty?

zależy od stosunku poligamii, zmienności liczby potomstwa i fluktuacji liczebności w czasie

Jaki rozkład ma wielkość rodziny w populacji wyidealizowanej (liczba potomków w ciągu całego monogamicznego życia pary zwierząt)?

ma rozkład Poissona o wartości oczekiwanej równej 2

Metody oceny efektywnej wielkości populacji

demograficzne (określające stan populacji w danym momencie) i genetyczne

metody genetyczne oceny efektywnej wielkości populacji

straty heterozygotyczności w czasie; zmiany frekwencji alleli z powodu dryfu; straty zmienności allelicznej; stopień wzrostu współczynnika inbredu szacowanego na podstawie rodowodu

Dopuszczalne tempo utraty zmienności populacji w niewoli

maksymalnie 5% w ciągu 100 lat

Podział populacji ze względu na układ przestrzenny fragmentów

całkowita izolacja populacji; układ źródło-ujście lub ląd-wyspy; metapopulacja

Układ źródło-ujście lub ląd-wyspy – charakterystyka

przepływ genów w jednym kierunku od źródła do ujścia

metapopulacja – charakterystyka

przepływ genów między fragmentami w obrębie metapopulacji, ale charakterystyczne jest ginięcie i rekolonizacja na obrzeżu metapopulacji

Z czego wynika zmienność częstości allelu w subpopulacji?

wynika z frekwencji początkowej i wielkości fragmentu

SL - single large

jedna duża populacja

SS - several small

kilka małych populacji

Czemu sprzyja izolacja poszczególnych grup (subpopulacji) tworzących populację?

sprzyja ich różnicowaniu

jak objawiają się różnice poszczególnych subpopulacji tworzących populację?

inna frekwencja alleli w populacjach; występowanie innych forum alleli w subpopulacjach (odpowiada to maksymalnej różnicy frekwencji)

Jak można wyrazić dystans dzielący subpopulacje?

można wyrazić przy pomocy indeksu F Wrighta (indeksu fiksacji)

Co może być wykorzystany do oceny stopnia podziału?

inbred jako skutek fragmentac

inbred całkowity F_it - podział

Inbred osobników w relacji do subpopulacji do której należą (F_is); inbred z powodu różnic między populacjami względem całej populacji (F_st)

Inbred osobników w relacji do subpopulacji do której należą (F_is) - charakterystyka

inaczej można wyjaśnić jako średnią wartość współczynnika inbredu dla wszystkich osobników we wszystkich subpopulacjach

inbred z powodu różnic między populacjami względem całej populacji (F_st)

Inaczej można wyjaśnić jako “fixation index” - efekt podziału na subpopulacje na wielkość inbredu, czyli prawdopodobieństwo wylosowania dwóch identycznych genów z danej subpopulacji

Od czego zależy wpływ fragmentacji populacji na jej zmienność genetyczną?

liczby “fragmentów” czyli subpopulacji; wielkości subpopulacji i ich rozproszenia; odległości między subpopulacja mi i barier (możliwość migracji); zdolności imigracyjnych gatunku; czasu, który upłynął od fragmentacji